Durch die Einführung der neuen Joker-Elemente können bei der auch Dokumentation Fehler passieren. Auf einen solchen Fehler wird im Dokuchecker-Protokoll in dem Kapitel "Warnungen" hingewiesen.
Wurde ein <einschub_innen>
oder ein <fn_einschub>
nicht dokumentiert, wird eine entsprechende Meldung ausgegeben.
Eine weitere Prüfung gibt Auskunft darüber, ob es zu einem dieser Elemente eine Dokumentation gibt, dieser Typ jedoch gar nicht im Werk vorhanden ist.
Beide Prüfungen werden auch für Register- und Typjoker durchgeführt.